Sequences of Spike-Ins used in Material and Methods Section 2.2.4.1 and Table 6. T7 promoter adds GGG to the beginning of the in vitro transcript
>Spike-In 2 (985 nt, 33 % GC)
GGGTGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAATTTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAGGATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGATTTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAATTTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGAGCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCATCCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTGGATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCACATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATAATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGGGTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCACCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTATTTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCAGATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGGAAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAAGAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGACCCAGGAAGAGTAATTAGGATTTTATAAACAAGATGG

>Spike-In 12 (950 nt, 35 % GC)
GGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAGGCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAATTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGCTGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGGCATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGTTGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATTTGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAACCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAATTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTCTTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCAGTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAAAAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTTATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTTGTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCTGGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATGCTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGA

>Spike-In 4 (1014 nt, 42 % GC)
GGGTTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAAACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCGAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGTGGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGTGCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGCGTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTACTCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCTGATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTTGGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCTGCTGACGCAAACAAGAGAGGCGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTATACGCCAGTTTCCCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAACTATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATTGCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGCTGGTTTAACTGACGAAGCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAAATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGTATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAATCTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAGACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTTCGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC

>Spike-In 5 (1014 nt, 44 % GC)
GGGACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAGCAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGAGAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAGCTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGCATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGTATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTTTCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTGCATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGGTCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTACATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGAACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCATATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAAAAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGGAGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGAAAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAATTTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGGCTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCG

>Spike-In 8 (1076 nt, 50 % GC)
GGGGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTATTACTGCAAGAGAGCGGACAGATTAGTGTGTTGGAGCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGGGACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGCGGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTACTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGACGTTTGTACGGATTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGCCTACCCATGGCTTTCGCGGCGACACATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCACTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGGTACCCGTGCCCGTCCGATTCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAATACCTGGCATTTGGGCACTTCTTGCGTTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATTTGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGGCTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCCCACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAACCAACCATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTAATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGTTACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGGCGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGGTTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGTTTTTTTGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTGCTCCGAAAGC

>Spike-In 9 (1037 nt, 51 % GC)
GGGCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGACCGTCGGCTGATCGTGGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATTCCTGGAGGAATAGGTACCAAGAAAAAAACGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGCACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCACAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGGAAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGAGGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCAATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGTTGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGCAGCGTCTGAGGAAGTTTGCTGCGGTTTCGCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATAGCGACTCTGTCTCAGGGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAGGTGGGCCTTGGCTTCCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGGGTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATGATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGACTTGTAAGGACCGCCGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTCTCGACGGGCTAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAGTACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGGTGCTTGCGTTTTACCC
